Eine der größten und vitalsten Seegraswiesen des Golfs befindet sich vor der Isonzomündung. Es handelt sich um Pflanzen mit grasartigen schmalen Blättern, Stengeln und Wurzeln (Rhizome) und richtigen Blüten. Sie spielen eine wesentliche Rolle für die Sauerstoffanreicherung des Wassers, dienen als Schutzort für die Fischlarven und liefern ein Substrat, auf dem sich andere tierische und pflanzliche Lebewesen festsetzen (Benthos). Normalerweise lebt in flacherem Wasser das Zwerg-Seegras, das es verträgt, aus dem Wasser aufzutauchen. In tieferem Wasser hingegen kommt das gemeine Seegras vor, das in der Lagune die typisch ringförmigen Bereiche („molere“) bedeckt. In Richtung Meer wird die Seegraswiese durch Tanggraswiesen (Cymodocea nodosa) ersetzt.